식도 종양, 비악성 조직의 메틸화 분석

Dec 03, 2023

정상 세포에서 발견되는 세포 유형별 부분 메틸화 도메인과 차별적으로 메틸화된 도메인이 악성 세포에서도 지속된다고 로스앤젤레스의 Cedars-Sinai Medical Center 및 다른 곳의 연구자들이 Genome Biology에 보고했습니다. 그들은 편평 세포 암종과 선암종 아형을 모두 나타내는 45개 식도 종양의 전체 게놈 중아황산염 서열 분석 프로파일을 분석하고 일치하는 비악성 조직을 분석했습니다. 연구진은 MMSeekR이라고 불리는 서열 인식 다중 모델 PMD 호출자를 사용하여 메틸화 수준과 종양 샘플 전체의 PMD 분포에서 높은 수준의 이질성을 발견했습니다. 이들 PMD가 게놈에 속하는 곳은 정상 세포에 존재한다고 보고했지만 종양 세포는 더 높은 수준의 손실을 나타내며 더 나아가 세포 유형별 H3K36me2 침착이 PMD가 게놈 전체에 분포되는 방식을 형성할 수 있다고 덧붙였습니다. 한편, DMR 수준에서 연구자들은 두 식도암 유형 사이에서 10,000개 이상의 hypo-DMR을 발견했으며, 또한 거기에서 많은 메틸화 변화가 정상 세포에도 존재한다는 점에 주목했습니다. 연구진은 "우리가 아는 한, 이는 정상, 전구체 및 악성 상태에 걸쳐 PMD의 두드러진 세포 유형 특이성을 최초로 입증한 것"이라고 썼습니다.